Le puzzle du millénium est un objet antique qui fut découvert en Egypte lors d'une expédition de Sugoroku.
Artefact mystérieux, personne n'a réussi à élucider son mystère, jusqu'au jour où Yugi reçu en cadeau le puzzle du millénium en pièces détachées. Il mit huit années avant de le monter dans son intégralité.
Depuis, l'esprit du Pharaon vieux de 3000 ans qui sommeillait dans le puzzle s'est réveillé et prend la place du petit Yugi dans les situations difficiles.
Le détenteur du puzzle du millénium est considéré comme le chef, seul le Pharaon est digne de le porter.
Il symbolise l'unité, même si le fait qu'il soit dirigé vers le bas représente les ténèbres.